目前中心内设办公室、财务及资产管理部、法务及客户关系部、国际合作及港澳台交流部、基础（职业）教育国际交流部、高等教育国际交流部、教师国际合作部、学生国际交流部、国际课程及考务部、留学部、来华留学部、签证及旅行项目部等12个部门。设有江苏省港澳台教育交流中心、教育部出国留学培训与研究中心。下属江苏省苏教国际教育文化交流中心、江苏教育国际旅行社、江苏教育国际咨询有限公司、江苏苏教国际预科专修学院等4个机构。负责管理运营英国苏曼教育国际发展有限公司、加拿大苏安中心、美国江苏加州国际教育发展中心、澳大利亚江苏维州国际教育发展中心等4个海外基地。